临床研究所的前身是1991年开设的临床研究实验室，1997年改称临床研究所，由研究开发室，中央实验室，研究支援室组成，主要进行临床医学研究相关的业务。2000年扩建了建筑面积为264㎡的临床研究所第二实验室，由4个研究室，共同机械室，会议室和动物保管室等组成，主要负责进行基础医学及临床医学相关的各种试验和研究的系统试验和研究。

当时的研究所由组织脏器医学研究分科、分子细胞医学分科、基因应用医学研究分科等3个研究分科组成，主要负责对患者的临床应用研究。这样的研究所扮演着促进地域社会保健和医学发展的双重角色。这对树立本院地位有着重要的作用。 同时，本所还进行了向医疗专家临床医生提供生命科学情报和诊疗教育研究调查的活动。在临床研究所的支援下，我们已经在国际学术杂志上发表了相当多的研究论文，而且学术论文发表的数量还在稳定持续地增加。 之后，我们扩建了包括基因龚学研究室、内分泌代谢研究室、影像医学研究室、藏起移植研究室、真菌研究室在内的动物试验室和同位素实验室、细胞基因研究室、微细手术实验室、病理组织实验室等，这样我们的研究活动向前迈进了一大步。

2006年，本研究所扩迁至医学专门大学院1幢3楼，同时增添了癌症专门研究中心和国家制定肾脏再生研究室、支气管开型控制研究室，共同实验室及人体资源中心银行，研究所又向前发展了一大步。此外，本研究所还每年定期召开覆盖各种主题和多种领域的国际学术会议讨论效用性及诊断研究方向等问题，为研究所的发展作出坚持不懈地努力。